Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRSAM1Q6UWE0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms