Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L2Q6R6M4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms