Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF7Q6Q0C0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms