Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC12Q6PEW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms