Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X7

TMEM71, Transmembrane protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM71Q6P5X7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM71Q6P5X7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM71Q6P5X7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM71Q6P5X7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms