Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC4Q6P4E1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASC4Q6P4E1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms