Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms