Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHLDB3Q6NSJ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHLDB3Q6NSJ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms