Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST2H2AA3Q6FI13 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms