Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN13Q68D06 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN13Q68D06 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms