Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9BQ674R7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG9BQ674R7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9BQ674R7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 672.6 ms