Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4Q643R3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms