Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP1ARQ63HQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1ARQ63HQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms