Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CLQ60I27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms