Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CARMIL1Q5VZK9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms