Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM46CQ5VWP2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM46CQ5VWP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms