Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD1Q5VV17 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms