Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRCH2Q5VUJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRCH2Q5VUJ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms