Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT2Q5VUG0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms