Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKAP1Q5VSY0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms