Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO4Q5TGY1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms