Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNJQ5T5M9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNJQ5T5M9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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