Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD3Q5T447 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HECTD3Q5T447 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms