Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms