Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR44Q5JSH3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR44Q5JSH3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms