Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC4Q5GLZ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC4Q5GLZ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms