Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO1Q5FBB7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO1Q5FBB7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO1Q5FBB7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms