Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAVIN4Q5BKX8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms