Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB6CQ53S08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms