Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HSD17B12Q53GQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms