Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAT3Q53EU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms