Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN52Q52LA3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms