Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT71Q3SY84 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT71Q3SY84 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms