Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP6Q3SY56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP6Q3SY56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms