Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLA2G4EQ3MJ16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLA2G4EQ3MJ16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms