Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
KRTAP21-3Q3LHN1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP21-3Q3LHN1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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