Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1BQ3KR37 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms