Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF8Q3BBV2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF8Q3BBV2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms