Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 314.41□□□□□ -0.16e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.156e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-209ENST00000555235 2282 ntTSL 213.74□□□□□ -0.216e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.216e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 313.69□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 513.51□□□□□ -0.256e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ZNF518A-205ENST00000488700 729 ntTSL 213.48□□□□□ -0.256e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.276e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.286e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.316e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 313.09□□□□□ -0.316e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.326e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.346e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.416e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.416e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARHGAP40-201ENST00000243967 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.41□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 412.35□□□□□ -0.436e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.456e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GTPBP1-203ENST00000458073 1350 ntTSL 512.18□□□□□ -0.464e-11■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.494e-11■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-206ENST00000557822 545 ntTSL 411.85□□□□□ -0.516e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.536e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHN2-203ENST00000409350 539 ntTSL 411.43□□□□□ -0.586e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 411.24□□□□□ -0.616e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 210.91□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GTPBP1-210ENST00000484971 582 ntTSL 310.85□□□□□ -0.674e-11■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.676e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 410.73□□□□□ -0.696e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-210ENST00000559343 577 ntTSL 410.65□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 510.49□□□□□ -0.736e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.746e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 TFB1M-204ENST00000470239 433 ntTSL 310.42□□□□□ -0.746e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.776e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.86e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-204ENST00000422039 564 ntTSL 49.94□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.836e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.846e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.866e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-207ENST00000558234 3910 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.866e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.886e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GTPBP1-206ENST00000462332 3035 ntTSL 29.45□□□□□ -0.94e-11■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-212ENST00000560004 544 ntTSL 49.36□□□□□ -0.916e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 49.18□□□□□ -0.946e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.976e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.026e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-226ENST00000561314 724 ntTSL 38.69□□□□□ -1.026e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.066e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 48.45□□□□□ -1.066e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHN2-205ENST00000409964 547 ntTSL 48.44□□□□□ -1.066e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 TXLNGY-203ENST00000445715 1915 ntBASIC8.18□□□□□ -1.16e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 TFB1M-201ENST00000367166 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.126e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-208ENST00000554627 1571 ntTSL 28.01□□□□□ -1.136e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 38□□□□□ -1.136e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.156e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.156e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 37.74□□□□□ -1.176e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 57.67□□□□□ -1.186e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-211ENST00000556744 1051 ntTSL 1 (best)7.52□□□□□ -1.216e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARID2-204ENST00000427628 323 ntTSL 57.43□□□□□ -1.226e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.236e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.236e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-210ENST00000556463 3584 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.246e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 57.29□□□□□ -1.246e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.276e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.336e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-223ENST00000561071 746 ntTSL 36.3□□□□□ -1.46e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.416e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.436e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ZNF518A-208ENST00000563195 1594 ntTSL 36.08□□□□□ -1.446e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.466e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 35.61□□□□□ -1.516e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.516e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARID2-203ENST00000426776 484 ntTSL 35.44□□□□□ -1.546e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-215ENST00000558787 758 ntTSL 25.42□□□□□ -1.546e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GPAM-203ENST00000480130 514 ntTSL 25.33□□□□□ -1.566e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.586e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 44.94□□□□□ -1.626e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 44.91□□□□□ -1.626e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.676e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ZNF518A-207ENST00000539666 485 ntTSL 44.53□□□□□ -1.686e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 54.22□□□□□ -1.736e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.796e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ZNF518A-203ENST00000478086 1579 ntTSL 1 (best)3.83□□□□□ -1.86e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GPAM-204ENST00000498541 351 ntTSL 33.68□□□□□ -1.826e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 TFB1M-205ENST00000475849 590 ntTSL 53.41□□□□□ -1.866e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 23.37□□□□□ -1.876e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.946e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -26e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 32.53□□□□□ -26e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.026e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.036e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.266e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 NR1H4-202ENST00000321046 1779 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.695e-6■■■■□ 19.6
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