Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMA4Q16363 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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