Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1Q15904 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms