Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA6Q15825 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA6Q15825 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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