Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA2Q15560 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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