Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR6A1Q15406 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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