Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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