Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX17Q15036 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX17Q15036 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms