Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSMD6Q15008 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD6Q15008 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD6Q15008 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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