Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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RAB39AQ14964 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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RAB39AQ14964 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAB39AQ14964 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAB39AQ14964 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAB39AQ14964 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB39AQ14964 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RAB39AQ14964 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RAB39AQ14964 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB39AQ14964 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB39AQ14964 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB39AQ14964 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB39AQ14964 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB39AQ14964 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB39AQ14964 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB39AQ14964 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB39AQ14964 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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