Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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