Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPNMBQ14956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.6 ms