Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX1Q14549 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms